仁科氏
仁科氏（にしなうじ）は、日本の氏族。系統は仁品王系・皇極太子系・桓武平氏繁盛流（信濃平氏）・清和源氏・義光流・武田支流。また、清和源氏頼季流乙葉氏族の仁科氏もある。
仁品王系仁科氏
祖は仁品王。『仁科濫觴記』にみられ、仁品主、仁品親王とも綴られる。仁科氏として知られる、おそらく最初の記録。「仁品」は、長野県池田町公民館所蔵の『仁科濫觴記』では「ひとしな」と訓じられているが、仁科宗一郎[1]は「にほん」と訓じることを主張している。同記録によれば、崇神天皇の末の太子であり、垂仁天皇の弟にあたる人物。都より降臨し、王町（現・大町市）に館を構え、犀川[2]の水を開いて安曇平を開墾し、仁科神明宮を建立した。子には、早世し若一王子神社として祭られた一ノ宮と、仁品王の跡を継いだ二ノ宮があった。
白雉2年（651年）には、二ノ宮から数えて21代目（つまり22代目）の子孫、高根伊勢（たかねのいせ）が継ぎ、一族は伊勢、出雲、隠岐、主膳の四家に分かれて栄えていた。
斉明天皇2年（656年）に、大海人皇子（天武天皇）に比定されうる「皇極ノ太子」の密命で、その3歳になる子が岡本宮から仁科の城主として派遣されたことにより、高根伊勢の代からは皇極太子系仁科氏の家臣に下ることとなる。その際、高根伊勢を国守に任命した。信濃国守に高根氏の名前があることは、『新撰仁科記』、『信濃宝鑑』にも見える。
皇極太子系仁科氏
「皇極ノ太子」の3歳の子は、仁品の館に入り、宝祚谷（ほそ(が)や）氏と名乗った。7歳のときに高明王（高明天王、高明親王）と名乗ることとなり、天智天皇7年（668年）には和泉守に被任したことから仁科和泉守高明（森和泉守）とも呼ばれる。この年、皇極ノ太子の命で、「仁品」は「日本」と訓が同じであることから、「仁科」と改めさせられた。ここで、仁科の姓が起こることとなる。
『仁科濫觴記』では、9世紀の仁科高明王の孫（祖父と同じ仁科和泉守という名）の代までの記述しかない。
平姓仁科氏
『岩城仁科系図』によると、平繁盛の後裔で仁科盛遠の時に仁科を姓としたのが始まりとなっている。しかし、『信濃史源考』によると、近年では奈良時代に古代豪族阿倍氏または安曇氏が信濃国安曇郡に定住、その支族が伊勢神宮の御領「仁科御厨」を本拠としたことを起源とする説がある。他にも奥州安倍貞任の末裔などという説もあり、出自はいまだ確定されていない。平姓関盛長の子が仁科義隆の婿となり、文和2年（1353年）に仁科の領主となったという関氏出身説もあるテンプレート:要出典。
鎌倉期には既に安曇の大豪族として知られるようになり、承久3年（1221年）の承久の乱では仁科盛遠の処遇が変勃発の一端ともなり、このとき仁科氏は宮方として後鳥羽上皇に味方している。南北朝の争いには南朝に属し、後に北朝側の守護小笠原氏に帰属するものの、大塔合戦では大文字一揆衆を率いて守護軍を圧倒。小笠原長秀を信濃から追い払う活躍を見せる。
その後、小笠原氏の配下に復帰して縁戚関係を結んでおり、戦国時代の天文年間に本格化した甲斐国守護武田氏の信濃侵攻においては小笠原や村上氏と同調して武田に抗していた。しかし『二木家記』や『小笠原系図』に名前が見られる仁科道外（盛能）は、天文17年（1548年）の塩尻峠の戦いを前に戦線離脱し、この戦いで小笠原長時が武田方に大敗する原因となった。
武田方の史料である『高白斎記』によれば天文19年に仁科上野介（盛政か）を介して武田氏に臣従している。武田方に帰属した仁科氏は千国街道の流通など支配権益を保障され、道外の孫である仁科盛政の頃には武田被官化するが、一族の間で内紛が発生し、更に盛政自身も川中島の戦いで上杉氏に寝返ったとして処刑され、仁科氏の正統は絶える。
武田信玄は信濃攻略において、諏訪氏など信濃名族に対して実子に名跡を継がせ親類衆に列して懐柔する方法を行っているが、仁科氏も五男に名跡を継がせた（仁科盛信）。以降仁科氏は平姓を改め、「清和源氏・義光流・武田氏支流」として源姓を名乗ることになる。
源姓仁科氏
テンプレート:日本の氏族 仁科信基と名乗る人物が詐称した家系。
次男の信貞は武田に復姓して明治時代に兵庫県に移住して武田の血を後世に残している。
美作仁科氏(2)（大伴氏後裔? 詳細は不明）
上記の仁科氏とは別で大伴氏の一族が奈良時代の頃に美作に土着したとされる。仁科氏が岡山県浅口郡濱中村（現・里庄町）に家を構え、領主の年貢のとりまとめをする庄屋をしていた。昭和期の物理学者・仁科芳雄はこの末裔にあたる。この仁科氏は多くの支流を出し、どれが美作仁科氏の宗家かは不明である。
明治時代に潰れた後は庄屋をしていた仁科氏達はそれぞれの道をたどる。そのため、岡山県浅口郡や備前市日生地域には仁科姓が多い。丸に梅鉢[1]または五七桐[2]を家紋にしていた。
会津仁科氏
福島県会津若松市に住んでいた仁科氏一族がある。これも嫡流とは別で清和源氏頼季流乙葉（おとは）氏族としているが詳細は不明である。
その他の仁科氏
小笠原氏の家臣に穂高・沢渡・渋田見・古厩・日岐・小宮の仁科氏一族が仕えたのと帰農した者にわかれている。また会津仁科氏と同族の仁科氏、桓武平氏繁盛流、大伴氏、安部氏など複数の氏族が仁科を名乗っている。
