フィリピン海溝(フィリピンかいこう)とは、フィリピン諸島のルソン島南東からミンダナオ島の東を経て、ハルマヘーラ島の北東沖に達する海溝。最深部の深さは1万m.を超えるとされる。別名、ミンダナオ海溝と呼ばれている。ユーラシアプレート(スンダプレート)とフィリピン海プレートの境界でもあり、フィリピン海プレートがユーラシアプレート下に沈みこんでいる。
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