ヌクレオチド
ヌクレオチド (nucleotide) とは、ヌクレオシドにリン酸基が結合した物質である。語源は“nucleo(核の)tide(結ばれた)”と言う意味であり、これをローマ字読みしたものである。英語では「ニュークリオタイド」と発音する。ヌクレオシドは五単糖の1位にプリン塩基またはピリミジン塩基がグリコシド結合したもの。DNAやRNAを構成する単位でもある。
ヌクレオチドが鎖のように連なりポリヌクレオチドになる。またアデノシン三リン酸はリン酸供与体としても機能し、加えてセカンドメッセンジャーの機能を持つcAMPなども知られる。遺伝暗号のコドンでは、ヌクレオチド3個でアミノ酸一つをコードしている。
命名法
略号 | 相当する略号 | 対する塩基 |
---|---|---|
A | A | T または U |
C | C | G |
G | G | C |
T または U | T | A |
M | AまたはC | K |
R | AまたはG | Y |
W | AまたはT | W |
S | CまたはG | S |
Y | CまたはT | R |
K | GまたはT | M |
V | AまたはCまたはG | B |
H | AまたはCまたはT | D |
D | AまたはGまたはT | H |
B | CまたはGまたはT | V |
XまたはN | AまたはCまたはGまたはT | X |
ヌクレオチドの名称は4文字の略号で表される。1文字目は糖の種類がリボヌクレオチド(r。省略する場合もある)かデオキシリボヌクレオチド (d) かを示す。2文字目は次の塩基の種類を示す。
すなわち、最初の2文字でヌクレオシドの種類が決まる。
3文字目は結合するリン酸基の数 (mono 1、di 2、tri 3) を、4文字目はリン酸塩 (P) であることを示す。
例えば、デオキシシチジン三リン酸 (deoxycytidine triphosphate) はdCTPと略される。また、4種類のデオキシリボヌクレオチド三リン酸 (dATP, dCTP, dGTP, dTTP) を混合したものはdNTPと表記する。
化学構造
各種リボヌクレオチド
Chemical structure of adenosine monophosphate Adenosine monophosphate AMP |
Chemical structure of adenosine diphosphate Adenosine diphosphate ADP |
Chemical structure of adenosine triphosphate Adenosine triphosphate ATP |
Chemical structure of guanosine monophosphate Guanosine monophosphate GMP |
Chemical structure of guanosine diphosphate Guanosine diphosphate GDP |
Chemical structure of guanosine triphosphate Guanosine triphosphate GTP |
Chemical structure of uridine monophosphate Uridine monophosphate UMP |
Chemical structure of uridine diphosphate Uridine diphosphate UDP |
Chemical structure of uridine triphosphate Uridine triphosphate UTP |
Chemical structure of cytidine monophosphate Cytidine monophosphate CMP |
Chemical structure of cytidine diphosphate Cytidine diphosphate CDP |
Chemical structure of cytidine triphosphate Cytidine triphosphate CTP |
各種デオキシヌクレオチド
ヌクレオチドの利用
ヌクレオチド及びその結合体であるポリヌクレオチド、DNA、RNAは生物を原料とするほとんどの食品に微量含まれている。これを摂取すると、体内でRNA、DNAを効率的に合成する材料となる。
グアニル酸 (GMP) やイノシン酸 (IMP) は呈味性ヌクレオチドと呼ばれ、自身がうま味をもつほか、L-グルタミン酸ナトリウムと組み合わせることで、うま味が強まる効果があり、うま味調味料や、スープ原料などとして使用されている。
また、岡山大学の研究チームが、神経伝達物質として働くヌクレオチドを取り込むタンパク質を見つけ、これと強い痛みを伝える働きとの関与を研究しており、この研究が抗てんかん剤の効きにくい人の発作を抑えたり、激しい痛みを和らげる新薬の開発につながるのではないかと期待されている(詳細はアデノシン三リン酸を参照)。