ユリアーキオータ門
ユリアーキオータ門(Euryarchaeota、ユーリ古細菌、エウリ古細菌、ユリアーキア/Euryarchaea)は、メタン菌や高度好塩菌を中心とした古細菌の分類群である。この他にも超好熱菌や好熱好酸菌、硫酸還元菌、嫌気的メタン酸化菌など多様な生物が含まれており、既知の古細菌の8割以上が分類される。下位分類としては7綱が記載され、原核生物の門としては最大の多様性を持つ。
1984年にレイクが古細菌界として定義したものである[1]。1990年にカール・ウーズが16SrRNA配列に従いユーリ古細菌界として再定義した。他の古細菌グループとは基本的に16S rRNA系統解析によって区別されており、形態・細胞表層構造、代謝系は非常に多様である。幅広い極限環境に適応していることから、ギリシャ語のευρυς(ラテン文字:eurys;エウリュス、意味:広い)にちなんで命名された。
特徴
16S rRNA系統解析により定義された門であり、共通する性質は乏しい。クレン古細菌との比較では、やや真正細菌寄りの細胞骨格や細胞分裂機構を持っている。Cdv機構の代わりにZリング関連タンパク質(FtsZ、Minなど)があり、MreBを持つものも多い。転写関連遺伝子(RpoG、Rpc34、Elf1)やリボソームタンパク質(S25e、S30e、L13e、L38e)のいくつかを保有しないことも特徴である。
メタン菌の系統が多く、主要8綱のうち4綱がメタン菌のみから構成され、1綱がメタン菌を1部含み、1綱がメタン菌ではないもののメタン生成経路を備えている。高度好塩菌もメタノミクロビウム綱の姉妹群とされる。メタン菌は全てこのユーリ古細菌に含まれる。
分類
- ユリアーキオータ門/Euryarchaeota
- アルカエオグロブス綱/Archaeoglobi - 硫酸、酸化鉄などを還元する嫌気性の超好熱菌。海洋熱水鉱床、油田などからの分離例が多い。
- アルカエオグロブス目/Archaeoglobales
- アルカエオグロブス科/Archaeoglobaceae
- アルカエオグロブス目/Archaeoglobales
- ハロバクテリウム綱/Halobacteria - 塩湖、塩田など好塩環境から分離される好気従属栄養生物。
- ハロバクテリウム目/Halobacteriales
- ハロバクテリウム科/Halobacteriaceae
- ハロバクテリウム目/Halobacteriales
- メタノバクテリウム綱/Methanobacteria
- メタノバクテリウム目/Methanobacteriales
- メタノバクテリウム科/Methanobacteriaceae - メタン菌。淡水系や動物の消化器官から分離例が多い。
- メタノテルムス科/Methanothermaceae - メタン菌。超好熱性。
- メタノバクテリウム目/Methanobacteriales
- メタノコックス綱/Methanococci
- メタノコックス目/Methanococcales - メタン菌。海洋性。
- メタノカルドコックス科/Methanocaldococcaceae - メタン菌。超好熱性。
- メタノコックス科/Methanococcaceae - メタン菌。海洋性。
- メタノコックス目/Methanococcales - メタン菌。海洋性。
- “メタノミクロビウム綱”/“Methanomicrobia” - メタン菌。淡水系や動物の消化器官から分離例が多い。
- メタノミクロビウム目/Methanomicrobiales
- メタノコルプスクルム科/Methanocorpusculaceae
- メタノミクロビウム科/Methanomicrobiaceae
- メタノスピリルム科/Methanospirillaceae
- メタノレグラ科/Methanoregulaceae
- メタノサルキナ目/Methanosarcinales
- メタノケッラ目/Methanocellales
- メタノケッラ科/Methanocellaceae
- メタノミクロビウム目/Methanomicrobiales
- メタノピュルス綱/Methanopyri - メタン菌。超好熱性。
- メタノピュルス目/Methanopyrales
- メタノピュルス科/Methanopyraceae
- メタノピュルス目/Methanopyrales
- テルモコックス綱/Thermococci - 海洋性の超好熱菌。
- テルモコックス目/Thermococcales
- テルモコックス科/Thermococcaceae
- テルモコックス目/Thermococcales
- テルモプラズマ綱/Thermoplasmata
- テルモプラズマ目/Thermoplasmales - 好熱好酸菌。
- メタノマッシリイコックス目/Methanomassiliicoccales
- メタノマッシリイコックス科/Methanomassiliicoccaceae - メタン菌。水田、脊椎動物など。
- DPANN系統(以下5系統は何れも未培養系統。各系統はユーリ古細菌ではなく独立門とする説もある)
- ディアフェロトリテス/"Diapherotrites"
- パルウ古細菌/"Parvarchaeota"(含むARMAN)
- アエニグム古細菌/"Aenigmarchaeota"
- ナノ好塩古細菌/"Nanohaloarchaeota"
- ナノ古細菌/"Nanoarchea"(=Nanoarchaeota)
- アルカエオグロブス綱/Archaeoglobi - 硫酸、酸化鉄などを還元する嫌気性の超好熱菌。海洋熱水鉱床、油田などからの分離例が多い。
この他にメタン酸化古細菌(ANME-1、ANME-2。おそらくメタノミクロビウム綱に近縁)を代表とした未培養系統が多数残されている。